Следующий этап второй фазы гаструляции заключается в погружении материала хордальной пластинки через передний край первичной ямки, соответствующий дорсальной губе бластопора, в промежуток между обоими первичными зародышевыми листками и вытягивании этого материала в направлении кпереди в форме «головного», или хордального, отростка. По бокам от этого отростка ложится материал мезодермы, погружающийся через края первичной бороздки (соответствующие боковым губам бластопора) в промежуток между обоими первичными листками и распространяющийся вперед и в стороны. В итоге зародыш становится трехслойным, а впереди от первичного узелка возникает осевой комплекс зачатков. Лишь немногие исследователи оспаривают такое представление о процессах, разыгрывающихся во второй фазе гаструляции у птиц. Так, Kopsch (1943) на основании экспериментов с маркировкой инкубируемых бластодисков тушью утверждает, что первичная полоска возникает не путем перемещений клеточного материала, а на месте в результате усиленной пролиферации клеток в задней медиальной части зародышевого щитка. Однако эксперименты подавляющего большинства исследователей с маркировкой бластодисков подтверждают трактовку Graper, основанную на наблюдениях с помощью микрокиносъемки (Pasteels, 1937). Данные Н. С. Габаевой, полученные методом маркировки сульфатом нильского синего, также не оставляют сомнений в правильности этих представлений.