В самом деле, этот термин применяется эмбриологами для обозначения как пространственного обособления зачатков у зародыша, так и появления качественной разнородности в первоначально однородном клеточном материале; наконец, просто для обозначения усложнения структуры и появления каких-либо признаков, отсутствовавших ранее. Гистологи же и цитологи называют дифференциацией, с одной стороны, появление различий между первоначально однородными клетками ткани (или зачатка), а с другой стороны — появление разнородных субцеллюлярных структур в первоначально однородной протоплазме клетки. Наконец, термин «дифференцировка» применяется как для обозначения процесса, так и в смысле результата этого процесса (говорят, например, о таких «дифференцировках» клеток кишечного эпителия, как апикальная каемка и замыкающие полоски). Из всего сказанного вытекает необходимость уточнения и, главное, расчленения понятия и термина «дифференциация». Прежде всего слово «дифференциация» будет здесь употребляться только для обозначения процесса появления разнородности в однородном; иначе говоря, не для обозначения каких-либо структур или образований, а только в смысле становления этих структур. Далее, должны быть отчетливо разграничены понятия онтогенетической и филогенетической дифференциации. Например, процесс обособления ядра от цитоплазмы, процесс образования в цитоплазме органоидов общего значения и т. д. есть филогенетическая дифференциация клетки (филоцитогенез, т. е. совокупность изменений, совершающихся в длинном ряду поколений организмов).