Рекапитуляция филогистогенеза может иметь место не только при эмбриональном гистогенезе, но и при регенерации. Так, у ракообразных (Л. Н. Жинкин, 1938), ланцетника (Л. Н. Жинкин, 1948), рыб (А. А. Заварзин, 1938) и некоторых других животных соматические мышечные волокна регенерируют путем слияния клеток — миобластов, образующихся за счет ядер и околоядерных участков саркоплазмы поврежденного волокна. Новообразование симпластического волокна из клеток — миобластов и дифференцировка в нем миофибрилл и поперечной исчерченности в данном случае рекапитулируют и эмбриональный гистогенез, и тем самым ход филогистогенеза. Само же возникновение миобластов из симпластического поврежденного волокна есть не что иное, как «атавистическое» пробуждение скрытых, филогенетически обусловленных возможностей («возврат» к примитивной клеточной структуре). Гладкие мышцы, регенерируя из камбиальных элементов соединительной ткани (С. И. Щелкунов, 1935), рекапитулируют свое филогенетическое соединительнотканное происхождение. При регенерации пластинчатой кости всегда сначала образуется более примитивная грубоволокнистая костная ткань, а иногда перед этим и хрящ. Однако, наряду с такими регенеративными гистогенетическими процессами, которые рекапитулируют филогенез в той мере, в какой они воспроизводят эмбриональный гистогенез (критический разбор проблемы соотношений между регенерацией и эмбриональным развитием см. Л. Д. Лиознер, 1956), наблюдаются и такие, которые атавистически воспроизводят состояния более древние, чем проходимые в эмбриональном гистогенезе. По отношению к регенеративному органогенезу таких случаев атавизма известно достаточно много (Е. А. Шульц, 1905; К. Н. Давыдов, 1908; П. П. Иванов, 1912, и др.)- Многие из них неизбежно связаны с атавистическими явлениями и в ходе гистогенеза. Так, К. Н. Давыдов (1908) описал у Enteropneusta при регенерации хобота не просто восстановление целомической поры, а образование настоящего нефридия с мерцательной воронкой — органа, по-видимому, имевшегося у предков современных Enteropneusta.