В дальнейшем, в середине XIX столетия, Н. И. Пирогов описал клинику и патологическую анатомию острого первичного генерализованного туберкулеза и выделил, в частности, тифоподобную форму милиарного туберкулеза. Кроме того, Н. И. Пирогов дал описание клиники туберкулеза легких, костей и суставов, мозговых оболочек и лимфатических узлов. Середина XIX столетия отмечена еще одним достижением, а именно экспериментальным доказательством инфекционной природы болезни, представленным Вильменом (Villemin, 1827-1892). В 1865 г. Вильмен доказал, что туберкулез человека можно привить животному. Он утверждал, что заболевание вызывается живым паразитом, подобно тем, которые открыты Пастером при ферментации и которые живут и размножаются в организме. Но это было лишь предположение, и только в 1882 г. немецкий ученый Роберт Кох (R. Koch, 1843-1910) открыл возбудителя туберкулеза — туберкулезную палочку (ныне называемую мпкобактерией туберкулеза). Он привел все доказательства, свидетельствующие о том, что она является единственной причиной заболевания и находится в мокроте больных туберкулезом, в лимфатических узлах при скрофулезе, в гное холодных абсцессов и пр. Это открытие было бесспорным подтверждением предположения Вильмена и положило начало современным исследованиям в области эпидемиологии и клиники туберкулеза, а также открыло дорогу обширным экспериментальным исследованиям, которые привели к современному пониманию процессов иммунитета при туберкулезе. Кох привел доказательства наличия иммунитета при туберкулезе. Непосредственным результатом этого открытия была более правильная организация профилактики туберкулеза. Ведь это было время, когда каждый седьмой человек умирал от туберкулеза.