Значительно больше расхождений имеется в теоретической трактовке фаз гаструляции у птиц. Часть исследователей не считает возможным относить образование первичной полоски и хордального отростка к гаструляции, а выделяет эти процессы в особый процесс, или период, «хордуляции» или «нотогенеза» (обзор литературы и подробное обоснование (С. Кацнельсон, 1948). Эта группа исследователей относит к гаструляции только обособление энтодермы и становление двуслойности зародыша. С другой стороны, например, А. А. Заварзин (19396), А. А. Заварзин и С. И. Щелкунов (1954) рассматривают гаструляцию как «продолжение дифференцировки» и «расстановку зачатков по своим местам». Конечно, в течение периода гаструляции, как и в течение любого другого периода эмбриогенеза, продолжается дифференцировка материала зародыша, но не в этом специфика гаструляции. Что же касается «расстановки зачатков по местам», то такое представление основано на преформистском предположении, что уже к началу гаструляции у зародышей позвоночных детерминированы «зачатки» органов и тканей. В действительности детерминация многих презумптивных областей завершается лишь в результате самой гаструляции, в ходе которой различные участки бластулы, перемещаясь, вступают друг с другом в «организующие» контакты (П. П. Иванов, 1939). Не следует смешивать презумптивный материал будущих зачатков, в большинство случаев у зародышей позвоночных еще не детерминированный, с самими зачатками, возникающими позднее в результате актов детерминации.