Можно было проследить последовательность изменений бокаловидных клеток (от клеток с пониженной секреторной активностью до клеток, специфическая функция которых, по-видимому, утрачена). Рядом с клетками, сохранившими отдельные признаки мерцательных клеток (цилиндрическая форма, наличие базальных телец в апикальной части цитоплазмы), располагались бокаловидные, структура которых отражала пониженную секреторную активность. Эти клетки имели цилиндрическую форму, надъядерная часть их цитоплазмы содержит меньше по количеству, но более плотные, чем в норме, гранулы секрета. Немногочисленные элементы комплекса Гольджи и эндоплазматического ретикулума разбросаны по всей цитоплазме. Содержимое цистерн ретикулума имело слабую электронную плотность. Характерно для таких бокаловидных клеток наличие около скоплений секреторных гранул большого количества лизосом и аутофагосом. Секреторные гранулы при этом чаще располагаются отдельными группами, по их периферии лежат лизосомы. Изредка встречались клетки, у которых секреторные гранулы были объединены одной общей мембраной и имели вид конгломерата. В составе конгломератов кроме гранул выявлялось большое количество рибосом. Цитоплазма таких клеток содержала значительное число лизосомоподобных гранул и почти не отличалась от цитоплазмы окружающих поверхностных клеток, лишенных ресничек. Поверхностные клетки тесно контактировали друг с другом, образуя в апикальной области межклеточных пространств терминальные перемычки обычной структуры. Боковые поверхности большинства клеток чрезвычайно извилисты из-за многочисленных длинных цитоплазматических выпячиваний типа микроворсинок. Ширина межклеточных пространств очень изменчива и колеблется от 10 — 20 нм до 1 мкм. Нижележащие клетки значительно отличались от поверхностных полигональной формой. Отростки их глубоковклинивались между поверхностными клетками, достигая иногда структур терминальных перемычек.