При возникновении мезодермы в качестве самостоятельного среднего зародышевого листка клетки ее, первоначально плотно сомкнутые и высокопризматические в составе первичной полоски, разрыхляются и разрозниваются, приобретая отростчатую форму. У высших позвоночных вся мезодерма имеет на ранних стадиях развития мезенхимоподобный облик, и лишь позднее, с образованием сомитов, спланхнотомов и нефротомов, клетки ее вновь смыкаются, образуя плотные зачатки. В клетках трех зародышевых листков по-разному локализованы и имеют неодинаковую форму митохондрии. В составе эпибласта они имеют тенденцию к полярной локализации, в клетках мезодермы, а вначале и энтодермы более равномерно рассеяны в цитоплазме. Различна степень базофилии цитоплазмы. У зародышей Sauropsida отчетливо видна также разница в величине и густоте распределения желточных включений. Самое же существенное заключается в том, что с момента своего обособления, т. е. после гаструляции, клеточный материал каждого из зародышевых листков становится детерминированным в направлении образования совершенно определенного, хотя все еще широкого, круга тканевых производных. Так, энтодерма у зародышей позвоночных способна давать начало только эпителиям энтеродермалыюго типа, эктодерма — только тканям эпидермального типа и элементам нервной системы и т. д. В пределах каждого из трех зародышевых листков сохраняется на протяягении довольно долгого периода взаимозаменяемость материала, но по отношению друг к другу зародышевые листки (подчеркиваем, что речь идет о позвоночных) не взаимозаменяемы.