Несомненным примером гистологического архаллаксиса, притом вторичного, может служить замещение (в ходе филогенеза) эпителия кишечного типа эпителием кожного типа в составе слизистой оболочки переднего отдела пищеварительной трубки у позвоночных. Вероятно, тем же обусловлено и наличие эпителия кожного типа (переходного эпителия) в составе мочеотводящих путей и аллантоиса. Отсутствие рекапитуляции при рассматриваемом модусе филэмбриогенеза затрудняет филогенетическую трактовку относящихся сюда процессов. В гистохимическом и биохимическом плане к архаллаксисам следует отнести случаи радикального изменения цепей синтетических реакций, начиная с первых же их звеньев. Кроме разобранных основных модусов филэмбриогенеза, А. Н. Северцов различает еще «способ периодического изменения хода развития органов» (например, возникновение периодического изменения хода гистогенеза при линьке у нематод, членистоногих и позвоночных, при течке и менструальных циклах у млекопитающих, смене рогов у оленей и т. д.). Однако А. Н. Северцов сам же подчеркивает (1939), что если при архаллаксисе мутации происходят «у филогенетически последующих поколений…, т. е. разных особей в ряду предков — потомков», то в рассматриваемых случаях «они происходят у одной и той же особи в одном и том же органе в последующие периоды жизни этой особи» (там же). Но тем самым вносится логическая неясность в определение модусов филэмбриогенеза: если речь идет об изменениях, происходящих в течение жизни одной и той же особи, то почему они должны рассматриваться как один из модусов филэмбриогенеза? Ведь само понятие филэмбриогенеза подразумевает изменение хода онтогенеза в ряду поколений. Другое дело, что подобные периодические изменения онтогенетических процессов сами накапливались постепенно в ряду поколений; например, количество ветвей рогов у оленей, достигаемое к концу онтогенеза, увеличилось в ходе эволюции. Но не вполне ясно, почему нельзя считать такое увеличение анаболией?